Resumen
Razones para realizar el estudio: La comunidad bacteriana intestinal del caballo es un determinante clave de la salud intestinal y de todo el organismo. Comprender la estructura y la función de la comunidad bacteriana es una base importante para los estudios sobre la salud y la enfermedad intestinales.
Objetivos: Describir la comunidad bacteriana fecal y los compuestos orgánicos volátiles (COV) del metaboloma fecal de caballos de carreras Thoroughbred sanos
y caracterizar las respuestas a la suplementación dietética con extracto de malta rico en amilasa.
Diseño del estudio: Estudio de intervención.
Métodos: Se recogieron muestras fecales de forma no invasiva antes y 6 semanas después de la suplementación en 8 caballos de carreras pura sangre de propiedad privada en entrenamiento activo. El metaboloma fecal se caracterizó mediante desorción térmica-cromatografía de gases-espectrometría de masas (TD-GC-MS), con análisis espectral realizado mediante AMDIS y comparado con la base de datos del NIST. La descripción taxonómica de la microbiota fecal se logró utilizando datos de pirosecuenciación 454 con corrección de errores a partir de amplicones del gen 16S rRNA.
Resultados: El metaboloma fecal de nuestra población de estudio estaba dominado por ácidos orgánicos, alcoholes y cetonas. Se identificaron 81 COV diferentes, de los cuales sólo 28 estaban presentes en más del 50% de las muestras, lo que indica diversidad funcional. Los perfiles de COV fecales difirieron entre el primer y el segundo punto de muestreo, y algunos COV se redujeron significativamente tras la suplementación, lo que concuerda con una marcada respuesta al extracto de malta rico en amilasa de la dieta. La microbiota fecal se caracterizó como altamente diversa; las muestras demostraron una diversidad verificable en el rango de 1200-3000 unidades taxonómicas operativas (OTU) por individuo. Los métodos utilizados también describen altos niveles de OTU infrecuentes y de baja abundancia. Se observó que la estructura de la comunidad microbiana fecal era diferente tras la administración de suplementos dietéticos. Se detectaron diferencias en varios taxones bacterianos de baja abundancia y también algunas pruebas de variación en la respuesta entre los caballos.
Conclusiones: El metaboloma volátil fecal de los caballos de carreras pura sangre está dominado por ácidos orgánicos, alcoholes y cetonas; este estudio demuestra que la suplementación dietética con extracto de malta rico en amilasa puede alterar significativamente el perfil de COV. El microbioma fecal es muy diverso y está dominado por Firmicutes y Bacteroidetes. Se detectaron cambios pequeños pero significativos en la estructura de la comunidad microbiana tras la administración de suplementos dietéticos. Este estudio describe el metaboloma fecal y el microbioma de caballos de carreras de pura sangre sanos, que pueden servir de referencia para futuros estudios sobre enfermedades e intervenciones dietéticas.
