Beim Menschen kann die Einnahme von Antibiotika drastische Auswirkungen auf das Mikrobiom haben, da sie den Anteil der "guten" Bakterien zusammen mit den pathogenen Bakterien reduziert (Maier et al. 2021). Dadurch wird das bakterielle Gleichgewicht gestört und die Produktion von kurzkettigen Fettsäuren (Essig-, Propion- und Buttersäure) verringert, die als Indikator für die Darmgesundheit gelten (Tierney et al. 2023). Eine längere Einnahme von Antibiotika macht den Menschen anfälliger für Darmprobleme wie Verstopfung/Durchfall (Dysbiose) (Martel et al. 2022; Nel Van Zyl et al. 2022) und auch für chronische Erkrankungen wie das Reizdarmsyndrom (Mamieva et al. 2022). Zu den Veränderungen des Mikrobioms gehören ein Verlust an bakterieller Vielfalt und Unterschiede im Bakterienprofil. So führt beispielsweise die Verwendung von Beta-Laktam-, Glykopeptid- und Makrolid-Antibiotika zu einer Verarmung der nützlichen Bakterien der Gattungen Bifidobacterium und Lactobacillus (Duan et al. 2022). Es kann lange dauern, bis die ursprüngliche Darmflora wiederhergestellt ist; dieser Prozess kann zwischen zwei oder drei Wochen und mehreren Monaten variieren, während gelegentlich eine dauerhaftere Veränderung eintritt (Huang et al. 2022).

Pferde scheinen in ähnlicher Weise darauf zu reagieren. Antibiotika spielen bei der Behandlung zahlreicher Pferdeprobleme eine große Rolle und sind als Therapeutika für bakterielle Infektionen sowie zur Vorbeugung von postoperativen und sekundären Infektionen von entscheidender Bedeutung (Khusro et al. 2021). Wie beim Menschen hat ihre Verwendung jedoch auch eine Kehrseite. Sulfonamide, Trimethoprim/Sulfonamid-Kombinationen, Penicilline wie Penicillin G und Ampicillin, Ceftiofur und Enrofloxacin können bei Pferden zu gastrointestinalen Nebenwirkungen führen, wenn die behandelten Tiere Durchfall, Koliken oder Kolitis entwickeln. Mehrere Antibiotika aus der Gruppe der Mycine sowie Tetracycline haben die gleichen Auswirkungen (Khusro et al. 2021). Diese beiden Klassen von Verbindungen haben ein breites Wirkungsspektrum und wirken gegen eine Reihe von Infektionen, so dass sie wahrscheinlich weit verbreitet sind. Antibiotika wie diese, die offensichtlich die Funktion des Darms beeinträchtigen, führen auch zu Veränderungen des Darmmikrobioms. Diese Dysbiose geht häufig mit einer Erhöhung der Durchlässigkeit der Darmwand einher, so dass beispielsweise die Einnahme von Trimethoprim-Sulfadiazin die Blutspiegel von LPS (Lipopolysaccharid) erhöht, das ein Biomarker für einen undichten Darm ist (Collinet et al. 2022). Auch Phenylbutazon, das bei Pferden zur Behandlung entzündlicher Erkrankungen eingesetzt werden kann, führt zu einem Anstieg der Darmdurchlässigkeit und verändert das Mikrobiom, wobei es zu einem Verlust von Bakterien der Familie der Lachnospiraceae kommt (Whitfield-Cargile et al. 2021). Wie beim Menschen können die Veränderungen lang anhaltend sein.

Diese Erkenntnisse haben zur Entwicklung von Behandlungen zur Wiederherstellung des Mikrobioms geführt. Der Einsatz von Prä-/Probiotika, Phagentherapie oder antimikrobiellen Peptidpolymeren wurde vorgeschlagen (Gibson und Owen 2023), und es wurde eine fäkale Mikrobiota-Transplantation (FMT) versucht. Die Protokolle für die FMT bei Pferden sind jedoch noch nicht zuverlässig genug, um diese Methode therapeutisch einsetzen zu können, so dass sie eine theoretische Möglichkeit bleibt (Di Pietro et al. 2023; Kinoshita et al. 2022). Nahrungsergänzungsmittel, die das Mikrobiom modulieren, könnten bei der Wiederherstellung des ursprünglichen Gleichgewichts und der Behandlung der antibiotikabedingten Dysbiose bei Pferden hilfreich sein. In Übereinstimmung mit dieser Theorie waren Formulierungen von ERME (Equinectar), die das Darmmikrobiom modulieren, in einer kleinen Pilotstudie erfolgreich, obwohl noch viel mehr Arbeit geleistet werden muss, bevor es klare Antworten auf das Problem gibt.